<h3>Описание задачи</h3>

<p>Ежегодно в рецензируемых журналах выходят миллионы научных статей, обогащающих человеческие знания о природе веществ. Обработка этой информации &ndash; значительный шаг к формированию химических баз данных и построению моделей, предназначенных для предсказания разнообразных свойств соединений. Однако, ручной сбор практически невозможен из-за колоссальных объемов данных, а общие большие языковые модели испытывают проблемы с химической терминологией, аббревиатурами, таблицами и структурными формулами, зачастую представленными в виде изображений. В рамках заключительного хакатона Академии искусственного интеллекта для школьников, участникам предоставляется возможность погрузиться в увлекательный процесс разработки проекта для интерпретации химических формул. Задача &ndash; создать систему, способную распознавать изображения органических молекул и переводить их в формат SMILES, уникальный язык, преобразующий сложные химические соединения в легко читаемые текстовые строки.</p>

<h3>Метрика</h3>

<p>Метрикой качества служит произведение двух величин: доли SMILES строк, которые соответствуют валидным молекулам, и средней схожести распознанных молекул с правильными по метрике Танимото. Обе величины изменяются от нуля до единицы, и задача участников получить максимальное значение.</p>

<h3><strong>Baseline</strong></h3>

<p>Приведенный пример решения задачи распознавания малых органических молекул по их изображениям базируется на encoder-decoder (&quot;кодировщик-декодировщик&quot;) системе. В качестве кодировщика используется ResNet сверточный слой, переводящий изображение в вектор фиксированной длины. Декодировщик представляет собой рекурентную нейронную сеть с LSTM механизмом внимания.</p>

<h3><strong>Данные</strong></h3>

<p>В качестве исходных данных для тренировки алгоритма предложены 100000 молекул из базы данных ChEMBL в виде SMILES строк и соответствующих 2D изображений. В рамках данного соревнования участниками также разрешается использовать любые химические базы данных и средства аугментации данных для расширения обучающего набора, если итоговое решение подходит под требования к формату, описанному ниже.</p>

<h3>Формат решений</h3>

<p>Решения запускаются в изолированном окружении при помощи Docker. Время и ресурсы во время тестирования ограничены. Модель должна принимать на вход путь к папке с изображениями и файлу indices.csv, содержащему колонку &quot;id&quot; с индексами изображений (изображения в папке именованы в формате индекс.расширение) Ответы, полученные моделью Участника, должны быть сохранены в файл predictions.csv, содержащий колонки &quot;id&quot; и &ldquo;smiles&rdquo;. Решения принимаются в виде zip-архива размером не более 5Gb, имеющего структуру:</p>

<ul>
<li>metadata.json</li>
<li>user_file_1</li>
<li>user_file_2</li>
<li>&hellip;</li>
<li>user_file_n</li>
</ul>

<p>В файле metadata.json должны быть два поля:</p>

<ul>
<li>image - публичный образ в DockerHub, например &ldquo;odsai/nto23:5.0&rdquo;</li>
<li>entry_point - команда для запуска в контейнере, например &ldquo;python run.py&rdquo;</li>
</ul>

<p>В течение одних суток Участник или Команда Участников может загрузить для оценки не более 5 решений.&nbsp;</p>

<p>Так как решение не имеет доступ к Интернету, все дополнительные данные, например, веса обученной модели, должны быть загружены в контейнер. В качестве примера организаторы предоставляют контейнер для запуска бейзлайн-решения.</p>

<p>Ресурсы для образа:</p>

<ul>
<li>8 vCPU</li>
<li>96Gb RAM</li>
<li>Nvidia V100, 32Gb</li>
<li>10Gb дискового пространства</li>
</ul>

<p>Время на исполнение - 45 минут:</p>

<ul>
<li>5 минут на check - не учитывается в метрике</li>
<li>20 минут на public</li>
<li>20 минут на private</li>
</ul>

Прими участие в заключительном хакатоне этого года от Академии ИИ! Ты сможешь попасть в сообщество самых сильных специалистов по ИИ среди школьников, а еще выиграть реальные деньги уже в школе!

Public

Private

Данные

User agreement

<p>Я прочитал(-а) и согласен(-на) с <a href="https://storage.yandexcloud.net/datasouls-ods/CourseFest_1/Docs/UserAgreement.pdf" rel="noopener noreferrer" target="_blank">Пользовательским соглашением и Политикой конфиденциальности</a></p>

Personal data

<p>Я даю свое <a href="https://storage.yandexcloud.net/ds-ods/files/data/docs/competitions/AIACADEMY2023/Persdata_underage.pdf" rel="noopener noreferrer" target="_blank">согласие</a> ООО &ldquo;Соревнования Анализа Данных&rdquo; на обработку и передачу моих персональных данных партнерам мероприятия для информационного взаимодействия</p>

Contest Rules

<p>Согласен (-на) с <a href="https://storage.yandexcloud.net/ds-ods/files/data/docs/competitions/AIACADEMY2023/AIACADEMY2023rules.pdf.pdf">Правилами Конкурса</a></p>

Consent

<p>Я <a href="https://storage.yandexcloud.net/datasouls-ods/CourseFest_1/Docs/Email.pdf" rel="noopener noreferrer" target="_blank">согласен(а)</a> получать информационные рассылки от ООО &ldquo;Соревнования Анализа Данных&rdquo;&nbsp;</p>

<p>You have reached the registration page of the Hackathon AI Academy 2023.</p>

email

Email

#	Teams (51)	Score	Similarity	Validity	Last	Entries
1	Alex Ast	0.89747	0.89747	1	14m	79
2	Andrey Khlopotnukh	0.85516	0.85516	1	14m	74
3	BadSolution	0.84278	0.84278	1	14m	39
4	BananaOverfitCapybarasFSD	0.83873	0.83873	1	14m	17
5	hate molecules	0.82895	0.82895	1	14m	33
6	Mer4lf	0.82478	0.82478	1	14m	3
7	Misha Murzaev	0.81267	0.81267	1	14m	59
OOC	Ваня Фикус	0.81137	0.81137	1	14m	6
8	Mikhail Antsev	0.81126	0.81126	1	14m	11
9	ZZAY	0.80976	0.80976	1	14m	11
10	krutie_perci	0.80832	0.80832	1	14m	9
11	xdd	0.75577	0.80332	0.9408	14m	26
12	P2Pteam	0.71826	0.77767	0.9236	14m	20
13	tooro	0.71793	0.77765	0.9232	14m	1
14	Аффинаж	0.645	0.645	1	14m	52
15	Timur Sarvarov	0.59728	0.60922	0.9804	14m	4
16	danil karpov	0.58451	0.58451	1	14m	25
17	Масло Масленное	0.40607	0.44052	0.9218	14m	51
18	4FUN	0.36424	0.51857	0.7024	14m	15
19	Валерий Тамразов	0.35658	0.48017	0.7426	14m	6
20	Denis Zhuk	0.21089	0.26289	0.8022	14m	15
21	Artiom Kholodilov	0.20817	0.25141	0.828	14m	3
22	Ravshan_and_Jamshut	0.19292	0.24507	0.7872	14m	20
23	qa554d1c8a7b0	0.14348	0.15627	0.9182	14m	2
24	сомнительный процент	0.1407	0.14577	0.9652	14m	9
25	КорИИчные зайки	0.13687	0.14124	0.969	14m	8
26	MR	0.12927	0.13221	0.9778	14m	8
27	bashmak	0.12532	0.13231	0.9472	14m	14
28	Danil	0.10867	0.10867	1	14m	26
29	ANDOR	0.10705	0.10765	0.9944	14m	18
30	Krylov Aleksandr	0.10687	0.10863	0.9838	15m	2
31	Igor Kartashov	0.10176	0.10176	1	14m	3
32	Artem Seleznev	0.09651	0.09838	0.981	14m	3
OOC	Miss Pibodi	0.09361	0.09597	0.9754	15m	1
33	скибиди туалеты топ1	0.09361	0.09597	0.9754	15m	1
34	костя сигалов	0.09361	0.09597	0.9754	15m	1
35	Maksim Aleksandrov	0.09361	0.09597	0.9754	15m	1
36	AI Siberia	0.09361	0.09597	0.9754	15m	1
37	Roman Pakhomov	0.09361	0.09597	0.9754	15m	1
38	Kira Prokhorova	0.09361	0.09597	0.9754	14m	1
39	Ian Gustov	0.09361	0.09597	0.9754	14m	2
40	twwist ww	0.09361	0.09597	0.9754	14m	1
41	Aleksandr Smirnov	0.09361	0.09597	0.9754	14m	1
42	rd0751713acb6	0.09361	0.09597	0.9754	14m	1
43	брутфорс	0.09361	0.09597	0.9754	14m	1
44	Dernil	0.09361	0.09597	0.9754	14m	1
45	tlr drdn	0.09361	0.09597	0.9754	14m	1
46	Дмитрий Быков	0.09361	0.09597	0.9754	14m	1
47	1511_Solo_ML	0.09361	0.09597	0.9754	14m	1
48	v72c8d5a5d8de	0.09361	0.09597	0.9754	14m	1