DL Researcher for protein design

Мы — мультидисциплинарная команда исследователей, работающая на стыке биоинформатики, структурной биологии и искусственного интеллекта. Основной фокус нашей группы — вычислительный дизайн белков, включая создание новых биомолекул с заданными свойствами для применения в медицине, биотехнологии и фундаментальной науке. Мы используем новейшие подходы из области машинного обучения, в том числе генеративные модели, предсказание структуры. Ищем себе в команду ребят с релевантными опытом, готовым работать на передовых задачах отролси.

AIRI - ведущий российский институт, разрабатывающий фундаментальные AI модели и продвигающие их в реальную жизнь.

• Разработка и применение ML/DL-алгоритмов для задач de novo дизайна белков, оптимизации стабильности, специфичности и функций белковых молекул
• Использование и доработка современных архитектур (AlphaFold, RoseTTAFold, ProteinMPNN, Diffusion-based models и др.)
• Валидация in silico результатов в сотрудничестве с экспериментальными лабораториями
• Подготовка научных публикаций, выступления на международных конференция

• Уверенные знания в области алгоритмов ML/DL (в частности, генеративные модели, графовые нейросети, трансформеры)
• Опыт работы с белковыми структурами и последовательностями, знание форматов (PDB, mmCIF), библиотек (Biopython, PyRosetta, MDAnalysis и др.)
• Владение Python, знание PyTorch и TensorFlow
• Умение разрабатывать воспроизводимые пайплайны анализа и работы с HPC
• Опыт публикаций в ведущих научных журналах
• Работа с Claude Code

Желательно:

• Опыт работы с диффузионными моделями для генерации белков
• Знание методов оценки белковых структур и свободной энергии (Rosetta, FoldX, MD-симуляции)
• Работа с базами данных UniProt, PDB, AlphaFold DB и др.
• Участие в работах, направленных на эксериментальный результат

• Гибридный график: офис - удаленка
• Офис в Москва Сити
• ДМС
• бонусы и скидки от компании